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Arlequin(人类遗传学数据分析软件) V3.5.2.2 绿色免费版

  Arlequin是专业的人类遗传学数据分析软件,为从事医学、生物学研究的学者设计,拥有可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等功能,例如:大量的分子序列数据和传统的等基因频率,并提供了很多的方法和统计学检验,能够满足用户多种遗传学分析方便的需求。

Arlequin

【功能说明】

  1、Molecular persity(分子多态性)

  2、Mismatch distribution(错配分布)

  3、Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计)

  4、Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联)

  5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡)

  6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验)

  7、Fu`s neutrality test(Fu中性检验)

  8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验)

Arlequin

  以上三个中性检验都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。

  9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等)

  10、Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异)

  11、AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构

  12、Pairwise genetic distances (遗传距离的估计)

  13、Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布)

  14、Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中)

标签: 科学分析数据分析医学研究

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